فهرست نرمافزارهای شیمی کوانتومی و فیزیک ماده چگال
نرمافزارهای محاسبات شیمی کوانتومی در شیمی محاسباتی برای پیادهسازی روشهای شیمی کوانتومی استفاده میشود. بیشتر آنها شامل روش هارتری-فوک (HF) و برخی از روشهای پسا از هارتری-قوک است. آنها همچنین ممکن است شامل تئوری عملکردی چگالی (DFT)، مکانیک مولکولی یا روشهای شیمی کوانتومی نیمه تجربی باشند. این برنامهها شامل نرم افزارهای منبع باز و تجاری یا آکادمیک هستند. بیشتر آنها مجموعههای بزرگ از چندین برنامه جداگانه هستند که طی سالهای متمادی تهیه شدهاند. این برنامهها در فیزیک حالت جالت جامد محاسباتی (محاسبات کوانتومی مواد)، شیمی فیزیک محاسباتی، رشتههای مرتبط با مهندسی مواد یا حتی در شاخههایی از مهندسی مکانیک و عمران نیز استفاده میشوند.
جدول زیر برخی از قابلیتهای اصلی آنها را نشان میدهد.
بسته نرمافزاری | پروانه | زبان برنامهنویسی | پایهها | دوره | مکانیک ملکولی | نیمه تجربی | روش هارتری-فاک | پساهارتریفوک | پیکربندی جندمرچعی برهمکنشها | نظریه تابعی چگالی | جی پی یو |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ABINIT | رایگان, گنو | فورترن | PW | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | آری |
ACES | رایگان, گنو | فورترن، سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
ACE-Molecule | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | Grid, Lagrange function(Sinc) | Any | نه | آری | نه | آری | نه | آری | آری, کودا |
AMPAC | دانشگاهی | ناشناخته | ناشناخته | ناشناخته | نه | آری | نه | نه | نه | نه | نه |
ADF | تجاری | فورترن | STO | Any | آری | آری | آری | نه | نه | آری | آری |
Atomistix ToolKit (ATK) | تجاری | سی پلاسپلاس، پایتون | NAO, EHT, PW | Any | آری | آری | نه | نه | نه | آری | نه |
BigDFT | رایگان, گنو | فورترن | Wavelet | Any | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری |
BrianQC | تجاری | سی پلاسپلاس، کودا | GTO | نه | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری |
CADPAC | دانشگاهی | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
CASINO (QMC) | دانشگاهی | فورترن ۲۰۰۳ | GTO, PW, Spline, Grid, STO | Any | نه | نه | آری | آری | آری | نه | نه |
CASTEP | دانشگاهی، تجاری | فورترن ۹۵, فورترن ۲۰۰۳ | PW | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
CFOUR | دانشگاهی | فورترن، سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | نه | نه |
COLUMBUS | دانشگاهی | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | آری | نه | نه |
CONQUEST | دانشگاهی | فورترن ۹۰ | NAO, Spline | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
CP2K | رایگان, گنو | فورترن ۹۵ | Hybrid GTO, PW | Any | آری | آری | آری | آری | نه | آری | آری, کودا and OpenCL |
CPMD | دانشگاهی | فورترن | PW | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
CRYSTAL | دانشگاهی (UK), تجاری (IT) | فورترن | GTO | Any | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
DACAPO | رایگان, گنو? | فورترن | PW | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
Dalton | رایگان, گنو الجیپیال | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | آری | آری | نه |
deMon2k | دانشگاهی، تجاری | فورترن | GTO | نه | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
DFTB+ | رایگان, گنو الجیپیال | فورترن، سی، پایتون | NAO, STO | Any | آری | آری | نه | نه | نه | نه | آری, MAGMA |
DFT++ (succeeded by JDFTx) | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | PW, Wavelet | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
DIRAC | دانشگاهی | فورترن ۷۷, فورترن ۹۰, سی | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | آری | آری | نه |
DMol3 | تجاری | فورترن ۹۰ | NAO | Any | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
ELK | رایگان, گنو | فورترن ۹۵ | FP-LAPW | 3d | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
Empire | دانشگاهی، تجاری | فورترن | Minimal STO | Any | نه | آری | نه | نه | نه | نه | نه |
EPW | رایگان, گنو | فورترن | PW | 2d, 3d | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
ErgoSCF | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
ERKALE | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
Exabyte.io | Cloud, Free Tier | پایتون | PW | 3d | Yes | ناشناخته | ناشناخته | ناشناخته | نه | Yes | Yes |
EXCITING | رایگان, گنو | فورترن ۹۵ | FP-LAPW | 3d | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
FLEUR | رایگان, MIT | فورترن ۹۵ | FP-(L)APW+lo | 1d, 2d, 3d | نه | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
FHI-aims | دانشگاهی، تجاری | فورترن | NAO | Any | آری | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
FPLO | تجاری | فورترن ۹۵, سی پلاسپلاس، Perl | LO+minimum-basis, NAO | Any | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
FreeON (formerly MondoSCF) | رایگان, گنو | فورترن ۹۵ | GTO | Any | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
Firefly (formerly PC GAMESS) | دانشگاهی | فورترن، سی، Assembly | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری | آری |
GAMESS (UK) | دانشگاهی (UK), تجاری | فورترن | GTO | نه | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری |
GAMESS (US) | دانشگاهی | فورترن | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری | آری |
گوسین (نرمافزار) | تجاری | فورترن | GTO | Any | آری | آری | آری | آری | نه | آری | آری |
GPAW | رایگان, گنو | پایتون، سی | Grid, NAO, PW | Any | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری |
HiLAPW | ناشناخته | ناشناخته | FLAPW | 3d | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
HelFEM | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | Finite elements | نه | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
HORTON | رایگان, گنو | پایتون، سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
HyperChem | تجاری | سی پلاسپلاس | STO, GTO | آری | آری | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
Jaguar | تجاری | فورترن، سی | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
JDFTx | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | PW | 3d | نه | نه | آری | نه | نه | آری | آری, کودا |
LOWDIN | دانشگاهی | فورترن ۹۵, ۰۳ | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
MADNESS | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | Wavelet | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
Maple Quantum Chemistry Package | تجاری | میپل، سی، فورترن، پایتون | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
MISSTEP | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | PW | نه | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
MOLCAS | دانشگاهی، تجاری | فورترن، سی، سی پلاسپلاس، پایتون، Perl | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری | آری |
OpenMOLCAS | رایگان, گنو الجیپیال | فورترن، سی، سی پلاسپلاس، پایتون، Perl | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری | آری |
MolDS | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | STO, GTO | نه | نه | آری | نه | نه | نه | نه | نه |
MOLGW | رایگان, گنو | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
MOLPRO | تجاری | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | آری | آری | آری |
MONSTERGAUSS | رایگان | فورترن | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | نه | نه |
MOPAC | دانشگاهی، تجاری | فورترن | Minimal GTO | Any | نه | آری | نه | نه | نه | نه | آری |
MPQC | رایگان, گنو الجیپیال | سی پلاسپلاس | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
MRCC | دانشگاهی | فورترن | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | آری | آری | نه |
NRLMOL | ناشناخته | فورترن | GTO | نه | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
NTChem | ناشناخته | ناشناخته | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
NWChem | رایگان, ECL v2 | فورترن ۷۷, سی | GTO, PW | Yes (PW), No (GTO) | آری | نه | آری | آری | نه | آری | آری, کودا |
Octopus | رایگان, گنو | فورترن ۹۵, سی | Grid | Any | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری, کودا and OpenCL |
ONETEP | دانشگاهی (UK), تجاری | فورترن | PW | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری, کودا |
OpenAtom | دانشگاهی | Charm++ (سی پلاسپلاس) | PW | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | آری |
OpenMX | رایگان, گنو | سی | NAO | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
ORCA | دانشگاهی، تجاری | سی پلاسپلاس | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | آری | آری | نه |
phase0 | رایگان, گنو | PW | ناشناخته | آری | نه | نه | آری | نه | |||
PLATO | دانشگاهی | ناشناخته | NAO | Any | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
PQS | تجاری | ناشناخته | ناشناخته | ناشناخته | آری | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
Priroda (see also [۱]) | دانشگاهی | سی | GTO | نه | نه | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
PSI | رایگان, گنو | سی، سی پلاسپلاس، پایتون | GTO | نه | نه | نه | آری | آری | آری | آری | نه |
PUPIL | رایگان, گنو | فورترن، سی | GTO, PW | Any | آری | آری | آری | آری | نه | آری | آری |
PWmat | تجاری | فورترن | PW | 3d | آری | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
PWscf | رایگان, گنو | فورترن | PW | 3d | نه | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
PyQuante | رایگان, بی اس دی | پایتون | GTO | نه | نه | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
PySCF | رایگان, بی اس دی | پایتون | GTO | آری | نه | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
Qbox | رایگان, گنو | سی پلاسپلاس | PW | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
Q-Chem | دانشگاهی، تجاری | فورترن، سی، سی پلاسپلاس | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | نه | آری | آری |
QMCPACK (QMC) | رایگان, U. Illinois Open Source | سی پلاسپلاس | GTO, PW, Spline, Grid, STO | Any | نه | نه | آری | آری | آری | نه | آری, کودا |
Quantemol-N | دانشگاهی، تجاری | فورترن | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | نه | نه | نه |
QSite | ناشناخته | ناشناخته | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
Quantum ESPRESSO | رایگان, گنو | فورترن | PW | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | آری, کودا |
RMG | رایگان, گنو | سی، سی پلاسپلاس | Grid | Any | آری | نه | نه | نه | نه | آری | آری, کودا |
RSPt | دانشگاهی | فورترن، سی | FP-LMTO | 3d | نه | نه | نه | نه | نه | آری | آری |
SAMSON | رایگان | سی پلاسپلاس، پایتون | Multiple | نه | آری | آری | نه | نه | نه | آری | نه |
Scigress | تجاری | سی پلاسپلاس، سی، جاوا، فورترن | GTO | آری | آری | آری | نه | نه | نه | آری | نه |
Siam Quantum | رایگان, گنو | سی | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | نه | آری | نه |
SIESTA | رایگان, گنو | فورترن | NAO | 3d | آری | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
Spartan | تجاری | فورترن، سی، سی پلاسپلاس | GTO | نه | آری | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
SPHInX | رایگان, مجوز آپاچی | سی پلاسپلاس | PW | 3d | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
TB-LMTO | دانشگاهی | فورترن | LMTO | 3d | نه | نه | نه | نه | نه | آری | نه |
TeraChem | تجاری | سی، کودا | GTO | نه | آری | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
TURBOMOLE | تجاری | فورترن | GTO | آری | آری | آری | آری | آری | نه | آری | نه |
VASP | دانشگاهی (AT), تجاری | فورترن | PW | 3d | آری | نه | آری | آری | نه | آری | آری |
WIEN2k | تجاری | فورترن، سی | FP-(L)APW+lo | 3d | آری | نه | آری | نه | نه | آری | نه |
xtb | دانشگاهی | فورترن | Minimal GTO | 3d | نه | آری | نه | نه | نه | نه | نه |
YAMBO code | رایگان, گنو | فورترن | PW | 3d | نه | نه | آری | آری | نه | نه | نه |
بسته نرمافزاری | پروانه | زبان برنامهنویسی | پایهها | دوره | مکانیک ملکولی | نیمه تجربی | روش هارتری-فاک | پساهارتریفوک | پیکربندی جندمرچعی برهمکنشها | نظریه تابعی چگالی | جی پی یو |
بستههای پردازش ثانویه در شیمی کوانتومی و فیزیک حالت جامد
بسته بندی | مجوز | زبان | ورودی | چه چیزی را محاسبه میکند |
---|---|---|---|---|
wannier90 | رایگان, گنو | فورترن | رابط با برخی از بستههای DFT | توابع وانییر بیشینه جایگزیده، چگالی حالات، فاز بری، ترابرد الکترونی |
پانویسها و منابع
"دانشگاهی": در صورت درخواست مجوز علمی (بدون هزینه) امکانپذیر است. "تجاری": توزیع تجاری.
پشتیبانی از سیستمهای دوره ای (کریستالهای ۳ بعدی، صفحات ۲ بعدی، ساختارهای یک بعدی و مولکولهای تکی): کدهای سه بعدی دوره ای امکان شبیهسازی با ابعاد کمتر در یک سلول بزرگ را دارند. در اینجا مشخصه دورهٔ کمتر دز شبیهسازی مد نظر است.
پروژه CAMPOS (که شامل Dacapo است) اعلام میکند که کلیه کدها GPL است. توزیع Dacapo حاوی مجوز نیست.
QuanPol طیف سنجی و یکپارچه است (HF, MCSCF, GVB, MP2، DFT, TDDFT, CHARMM, AMBER, OPLSAA) QM / MM بستهبندی شده در GAMESS-US.
از طریق Ascalaph
از طریق رابط به MOPAC
با استفاده از نظریه تابعی چگال مبادلهای دقیق
با Quantum ESPRESSO توزیع شدهاست
سرویس وب تلفیق MPQC.
TeraChem اولین نرمافزار شیمی کوانتومی که بهطور کامل بر پایه پردازنده گرافیکی است.
Atomistix ToolKit همچنین حاوی محاسبات ترابرد با پایه محدود NEGF با شرایط مرزی باز است.
از طریق برنامه CRYSCOR بایگانیشده در ۲۶ دسامبر ۲۰۱۹ توسط Wayback Machine.
با این حال، موجود در مجموعه Schrödinger.
SIESTA همچنین حاوی محاسبات ترابرد الکترونی پایه محدود NEGF با شرایط مرزی باز با استفاده از TranSIESTA است.
FPLO محاسبات تمام نسبیتی دارد.
در سپتامبر ۲۰۱۷، بخش بزرگی از MOLCAS تحت LGPL منتشر شد.
فقط نقطه گاما.
پشتیبانی از محاسبات MRCI فقط در انواع FOCI (مرتبه اول CI) و SOCI (مرتبه دوم CI).
محاسبات MRCI را فقط به صورتهای داخلی انجام میدهد (دو نوع ممکن است).
پشتیبانی از محاسبات از نوع MRCI اگرچه بهطور کلی انتخاب شدهاست.
هر دو MRCI کامل، بدون انعطافپذیری را پشتیبانی میکند و MRCI را با استفاده از دو طرح انقباضی منعقد میکند.
نرمافزارهای دیگر
جستارهای وابسته
- نرمافزارهای محاسبات شبیهسازی مولکولی مونت کارلو
- نرماقزارهای مقایسهگر در شبیهسازهای مکانیک ملکولی
- نرمافزارهای طراحی ساختارهای ملکولی
- ویرایشگرهای ملکولی
- شبیهسازی ملکولی روی پردازشگر گرافیکی
- لیست نرمافزارهای شبیهسازی ساختارهای نانو
- روشهای شیمی کوانتومی نیمه تجربی
- روشهای شیمی محاسباتی در فیزیک حالت جامد، با شرایط مرزی دورهای
- نرمافزارهای ظرفیت پیوندی
- دینامیک ملکولی کارل پارینلو
منابع
- ↑ "Order MOLCAS".
- ↑ Kaneko, Tomoaki; Tajima, Nobuo; Yamasaki, Takahiro; Nara, Jun; Schimizu, Tatsuo; Kato, Koichi; Ohno, Takahisa (2018). "Hybrid density functional analysis of distribution of carbon-related defect levels at 4H-SiC(0001)/SiO2 interface". Applied Physics Express. 11 (1): 011302. Bibcode:2018APExp..11a1302K. doi:10.7567/APEX.11.011302. ISSN 1882-0778.
- ↑ Change History of GAMESS
خواندن بیشتر
- Young, David (2001). Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems. New York: John Wiley & Sons. pp. 322–359. ISBN 978-0-471-33368-5.
- "NVIDIA GPU Applications". NVIDIA. Retrieved 9 July 2014.
- "Major codes in electronic-structure theory, quantum chemistry, and molecular-dynamics - Nomad repository". NOMAD. Retrieved 19 November 2017.