حساب کاربری
​
زمان تقریبی مطالعه: 3 دقیقه
لینک کوتاه

ATG12

مولکول ۱۲ مرتبط با خودخواری (انگلیسی: Autophagy related 12) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «ATG12» کُدگذاری می‌شود.

ATG12
ساختارهای موجود
PDBجستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB
فهرست شناسه‌های PDB

4GDK, 4GDL, 4NAW

معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگرATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, autophagy related 12
شناسه‌های بیرونیOMIM: 609608 MGI: 1914776 HomoloGene: 37953 GeneCards: ATG12
موقعیت ژن (موش)
کروموزومکروموزوم ۱۸ (موش)
موقعیت ژنومی ATG12
موقعیت ژنومی ATG12
نوار18|18 Cشروع46,863,211 bp
پایان46,874,647 bp
الگوی گسترش RNA




More reference expression data
هستی‌شناسی ژن
عملکرد ملکولی• GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی
• Atg8 ligase activity
ترکیبات سلولی• سیتوپلاسم
• سیتوزول
• phagophore assembly site membrane
• phagocytic vesicle membrane
• Atg12-Atg5-Atg16 complex
• membrane
• autophagosome
• GO:0009327 protein-containing complex
فرایند زیستی• خودخواری
• autophagy of nucleus
• C-terminal protein lipidation
• میتوفاژی
• macroautophagy
• autophagosome assembly
منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌هاانسانموش
Entrez

9140

67526

آنسامبل

ENSG00000145782

ENSMUSG00000032905

یونی‌پروت

O94817

Q9CQY1

RefSeq (mRNA)

NM_001277783، NM_004707، NR_033362، NR_033363، NR_073603 NR_073604، NM_001277783، NM_004707، NR_033362، NR_033363، NR_073603

XR_004939883 NM_026217، XR_004939883

RefSeq (پروتئین)

NP_004698 NP_001264712، NP_004698

NP_080493

موقعیت (UCSC)ن/مChr : 46.86 – 46.87 Mb
جستجوی PubMed
مشاهده/ویرایش موش

برای شروع خودخواری لازم است این مولکول به پروتئین ATG5 از طریق یک سامانهٔ اتصالی شبه یوبیکوتینی، پیوند کووالانسی ایجاد کند. سپس این ترکیب مولکولی دوگانه خودش باعث اتصال پروتئین ATG8 به فسفاتیدیل اتانل آمین می‌گردد.

این مولکول همچنین در آپوپتوز هم دخالت دارد و اینکار را از طریق تعامل با مولکول‌های ضد آپوپتوزی خانواده Bcl-2 انجام می‌دهد.

منابع

  1. ↑ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032905 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ↑ Mizushima N, Sugita H, Yoshimori T, Ohsumi Y (Jan 1999). "A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy". J Biol Chem. 273 (51): 33889–33892. doi:10.1074/jbc.273.51.33889. PMID 9852036.
  5. ↑ "Entrez Gene: ATG12 ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae)".
  6. ↑ J. Geng, and D. J. Klionsky, 'The Atg8 and Atg12 Ubiquitin-Like Conjugation Systems in Macroautophagy. 'Protein Modifications: Beyond the Usual Suspects' Review Series', EMBO Rep, 9 (2008), 859-64.
  7. ↑ A. D. Rubinstein, M. Eisenstein, Y. Ber, S. Bialik, and A. Kimchi, 'The Autophagy Protein Atg12 Associates with Antiapoptotic Bcl-2 Family Members to Promote Mitochondrial Apoptosis', Mol Cell, 44 (2011), 698-709

    برای مطالعهٔ بیشتر

    • Prigione A, Cortopassi G (2007). "Mitochondrial DNA deletions and chloramphenicol treatment stimulate the autophagic transcript ATG12". Autophagy. 3 (4): 377–80. doi:10.4161/auto.4239. PMID 17457038.
    • Ewing RM; Chu P; Elisma F; et al. (2007). "Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
    • Rual JF; Venkatesan K; Hao T; et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–1178. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
    • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
    • Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
    • Mizushima N; Kuma A; Kobayashi Y; et al. (2004). "Mouse Apg16L, a novel WD-repeat protein, targets to the autophagic isolation membrane with the Apg12-Apg5 conjugate". J. Cell Sci. 116 (Pt 9): 1679–1688. doi:10.1242/jcs.00381. PMID 12665549.
    • Mizushima N, Yoshimori T, Ohsumi Y (2003). "Mouse Apg10 as an Apg12-conjugating enzyme: analysis by the conjugation-mediated yeast two-hybrid method". FEBS Lett. 532 (3): 450–454. doi:10.1016/S0014-5793(02)03739-0. PMID 12482611. S2CID 37247321.
    • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
    • Tanida I; Nishitani T; Nemoto T; et al. (2002). "Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing". Biochem. Biophys. Res. Commun. 296 (5): 1164–1170. doi:10.1016/S0006-291X(02)02057-0. PMID 12207896.
    • Tanida I; Tanida-Miyake E; Nishitani T; et al. (2002). "Murine Apg12p has a substrate preference for murine Apg7p over three Apg8p homologs". Biochem. Biophys. Res. Commun. 292 (1): 256–262. doi:10.1006/bbrc.2002.6645. PMID 11890701.
    • Tanida I; Tanida-Miyake E; Komatsu M; et al. (2002). "Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p". J. Biol. Chem. 277 (16): 13739–13744. doi:10.1074/jbc.M200385200. PMID 11825910.
    • Ueno K; Kumagai T; Kijima T; et al. (1998). "Cloning and tissue expression of cDNAs from chromosome 5q21-22 which is frequently deleted in advanced lung cancer". Hum. Genet. 102 (1): 63–68. doi:10.1007/s004390050655. PMID 9490301. S2CID 36201527.
    • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.

    پیوند به بیرون

    • مکان ژنوم ATG12 انسانی و صفحهٔ جزئیات ژنی ATG12 در سامانه جستجوی بانک ژنی دانشگاه کالیفرنیا، سانتا کروز.
    آخرین نظرات
    • ژن
    کلیه حقوق این تارنما متعلق به فرا دانشنامه ویکی بین است.