گرمیسیدین

گرمیسیدین
داده‌های بالینی
کد ATC	R02AB30 ;
شناسه‌ها
شمارهٔ CAS	۱۴۰۵-۹۷-۶;
پاب‌کم CID	۱۶۱۳۰۱۴۰;
دراگ‌بنک	DB00027;
کم‌اسپایدر	۳۰۷۶۴۰۳;
UNII	5IE62321P4;
KEGG	D04369;
ChEMBL	ChEMBL۵۵۷۲۱۷;
ECHA InfoCard	100.014.355
داده‌های فیزیکی و شیمیایی
فرمول شیمیایی	C۹۹H۱۴۰N۲۰O۱۷
جرم مولی	۱۸۸۲٫۳۳۲ g·mol
مدل سه بعدی (جی‌مول)	Interactive image;
نقطه ذوب	۲۲۹ تا
حلالیت در آب	۰٫۰۰۶میلی‌گرم در میلی‌لیتر (دمای C°۲۰)
	SMILES C[C@@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC5=CNC6=CC=CC=C65)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC7=CNC8=CC=CC=C87)C(=O)NCCO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C(C)C)NC=O;
	InChI InChI=1S/C60H92N12O10/c1-35(2)31-43-53(75)67-45(33-39-19-11-9-12-20-39)59(81)71-29-17-25-47(71)55(77)70-50(38(7)8)58(80)64-42(24-16-28-62)52(74)66-44(32-36(3)4)54(76)68-46(34-40-21-13-10-14-22-40)60(82)72-30-18-26-48(72)56(78)69-49(37(5)6)57(79)63-41(23-15-27-61)51(73)65-43/h9-14,19-22,35-38,41-50H,15-18,23-34,61-62H2,1-8H3,(H,63,79)(H,64,80)(H,65,73)(H,66,74)(H,67,75)(H,68,76)(H,69,78)(H,۷۰٬۷۷); Key:IUAYMJGZBVDSGL-UHFFFAOYSA-N;
	(verify)

	دی‌مرهای سر به سر گرمیسیدین A
شناسه‌ها
نماد	N/A
TCDB	1.D.1
OPM superfamily	65
OPM protein	1grm

گرمیسیدین،(به انگلیسی: Gramicidin) که با نام گرمیسیدین D نیز نامیده می‌شود، ترکیبیست از آنتی بیوتیک‌های یون‌بر، گرمیسیدین A و B و C با نسبت درصد در حدود ۸۰٪، ۵٪، و ۱۵٪. هر کدام از این ساختارها دارای دو ایزوفرم پروتئینی است ، بنابراین مخلوط دارای ۶ نوع مختلف مولکول گرمیسیدین است. این ترکیبات می‌توانند از باکتریهای خاک Brevibacillus brevis استخراج شوند. گرمیسیدین‌ها پپتیدهای خطی با ۱۵ اسید آمینه هستند. این ساختار بر خلاف گرامیسیدین S است که یک پپتید حلقوی است.

ساختار گرمیسیدین B, A و C

منابع

↑
↑ Kessler N, Schuhmann H, Morneweg S, Linne U, Marahiel MA (February 2004). "The linear pentadecapeptide gramicidin is assembled by four multimodular nonribosomal peptide synthetases that comprise 16 modules with 56 catalytic domains". The Journal of Biological Chemistry. 279 (9): 7413–9. doi:10.1074/jbc.M309658200. PMID 14670971.

[:m-1] ↑

[:0-2] Kessler N, Schuhmann H, Morneweg S, Linne U, Marahiel MA (February 2004). "The linear pentadecapeptide gramicidin is assembled by four multimodular nonribosomal peptide synthetases that comprise 16 modules with 56 catalytic domains". The Journal of Biological Chemistry. 279 (9): 7413–9. doi:10.1074/jbc.M309658200. PMID 14670971.

داده‌های بالینی
کد ATC	R02AB30
شناسه‌ها
شمارهٔ CAS	۱۴۰۵-۹۷-۶
پاب‌کم CID	۱۶۱۳۰۱۴۰
دراگ‌بنک	DB00027
کم‌اسپایدر	۳۰۷۶۴۰۳
UNII	5IE62321P4
KEGG	D04369
ChEMBL	ChEMBL۵۵۷۲۱۷
ECHA InfoCard	100.014.355
داده‌های فیزیکی و شیمیایی
فرمول شیمیایی	C_۹۹H_۱۴۰N_۲۰O_۱۷
جرم مولی	۱۸۸۲٫۳۳۲ g·mol
مدل سه بعدی (جی‌مول)	Interactive image
نقطه ذوب	۲۲۹ تا
حلالیت در آب	۰٫۰۰۶میلی‌گرم در میلی‌لیتر (دمای C°۲۰)
SMILES C[C@@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC5=CNC6=CC=CC=C65)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC7=CNC8=CC=CC=C87)C(=O)NCCO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C(C)C)NC=O
InChI InChI=1S/C60H92N12O10/c1-35(2)31-43-53(75)67-45(33-39-19-11-9-12-20-39)59(81)71-29-17-25-47(71)55(77)70-50(38(7)8)58(80)64-42(24-16-28-62)52(74)66-44(32-36(3)4)54(76)68-46(34-40-21-13-10-14-22-40)60(82)72-30-18-26-48(72)56(78)69-49(37(5)6)57(79)63-41(23-15-27-61)51(73)65-43/h9-14,19-22,35-38,41-50H,15-18,23-34,61-62H2,1-8H3,(H,63,79)(H,64,80)(H,65,73)(H,66,74)(H,67,75)(H,68,76)(H,69,78)(H,۷۰٬۷۷) Key:IUAYMJGZBVDSGL-UHFFFAOYSA-N
(verify)